Les deux couleurs de base chez l'ovin sont le noir et le brun.
Chez le mouton d'Ouessant, les toisons noires sont les plus communes, tout comme cela semblait être le cas dans les anciennes populations ovines bretonnes sur la partie la plus récente de leur histoire.
Les véritables toisons brunes (expression d'un gène récessif au noir), personne ne pourra jamais en prouver l'existence ou l'inexistence dans l'histoire d' une population ovine ouessantine vieille de plusieurs millénaires. Cependant, cette couleur figure dans le premier recensement de la race (début des années 80) au sein du GEMO (Groupement des Eleveurs du Mouton d'Ouessant) par mention de quelques animaux belges. Cette couleur brune est de plus inscrite au standard du Ouessant, celui-ci acceptant d'ailleurs toute toison unie.
Noir et brun sont génétiquement les deux couleurs de base de cet ovin. Réunies chez les Lutins, Guanine et Shéhérazade nous les présentent.